Hlavným správnym orgánom pre bezpečnosť a ochranu zdravia pri práci v Chorvátsku je ministerstvo práce, dôchodkového systému, rodiny a sociálnej politiky. V oblasti BOZP úzko spolupracuje s ministerstvom zdravotníctva. Do uplatňovania bezpečnosti a ochrany zdravia pri práci sú zapojené tri ďalšie inštitúcie:
- Národný inšpektorát práce, čo je ústredný vládny orgán, ktorý vykonáva kontroly v 10 oblastiach vrátane inšpekcií práce a BOZP. Existuje 17 inšpekcií v rôznych oblastiach vrátane inšpekcie práce, ktorá sa zameriava na kontrolu pracovných podmienok a BOZP.
- Chorvátsky ústav verejného zdravia je vedúcim orgánom verejného zdravia v krajine. V ústave existuje odbor bezpečnosti práce, ktorého úlohou je zlepšovať ochranu zdravia pracujúcich.
- Chorvátsky fond zdravotného poistenia je inštitúciou, ktorá financuje ochranu zdravia a bezpečnosť pri práci a na jeho činnosť takisto dohliada ministerstvo zdravotníctva.