Horvaatia Vabariigi peamine tööohutuse ja töötervishoiu haldusorgan on töö-, pensionisüsteemi, perekonna- ja sotsiaalpoliitika ministeerium. Horvaatia teeb töötervishoiu ja tööohutuse valdkonnas tihedat koostööd tervishoiuministeeriumiga. Tööohutuse ja -tervishoiu rakendamisega töökohal tegelevad veel kolm asutust:
- Riiklik inspektsioon on keskne valitsusasutus, mis täidab inspektsiooniülesandeid 10 valdkonnas, sh tööhõive ning tööohutuse ja töötervishoiu valdkonnas. Eri valdkondade jaoks on 17 inspektsiooni, sh tööinspektsioon, mis tegeleb tööhõive ning tööohutuse ja töötervishoiuga.
- Horvaatia rahvatervise instituut on riigi juhtiv rahvatervise asutus. Instituudi struktuuris on töötervishoiu osakond, mille eesmärk on parandada töötajate tervise kvaliteeti.
- Tervishoiuministeeriumi järelevalve all tegutsev Horvaatia tervisekindlustusfond rahastab tervisekaitset ja ohutust töökohal.