Valdančiosios tarybos veiklą reglamentuoja darbo tvarkos taisyklės. Laikydamiesi Agentūros interesų konfliktų prevencijos ir valdymo politikos, Valdančiosios tarybos nariai kas 4 metus pateikia deklaraciją dėl interesų ir interesų konflikto nebuvimo.
Valdančioji taryba renkasi du kartus per metus ir jos posėdžių protokolai skelbiami viešai (žr. toliau).