La loi sur la santé et la sécurité au travail, adoptée par le parlement estonien (Riigikogu), est le principal outil législatif sous-tendant le domaine de la santé et de la sécurité au travail en Estonie; plusieurs réglements du gouvernement et du ministère des affaires sociales estoniens ont été élaborés et mis en oeuvre sur la base de cette loi (entrée en vigueur le 26 juillet 1999). Le ministère des affaires sociales est l'autorité exécutive qui régule l'ensemble du système estonien de santé et de sécurité, tandis que deux de ses unités structurelles (le département du développement de la vie au travail et le département des soins de santé) participent directement à l'élaboration de politiques en matière de sécurité et de santé au travail. Le point focal national estonien pour l'EU-OSHA agit dans le cadre du ministère des affaires sociales (département du développement de la vie au travail). Le réseau du point focal compte à présent 16 organisations gouvernementales ou non gouvernementales.
Le point focal national agit en tant que représentant de l'Agence en Estonie; il intervient en tant qu'organe intermédiaire entre l'Agence et l'État membre pour les activités pertinentes, et en tant qu'organe de coordination pour les activités au niveau de l'État membre. Le site web du point focal vise à fournir des informations complètes tant au niveau national qu'au niveau de l'UE sur les questions de santé et de sécurité au travail, notamment en ce qui concerne les bonnes pratiques et les campagnes européennes.
La supervision par l’État du droit du travail et du respect des exigences en matière de santé et de sécurité au travail est assurée par l’inspection du travail. L’inspection du travail dispose également d’une ligne d’information à laquelle les employeurs et les travailleurs peuvent adresser leurs questions concernant le droit du travail et l’environnement de travail.