Il principale documento nel quale si evidenzia il settore della sicurezza e la salute professionale in Estonia è l'Atto sulla sicurezza e la salute professionale adottato dal Parlamento estone - il Riigikogu - in base al quale sono state elaborate e promulgate numerose normative del governo della Repubblica e del ministero degli Affari sociali (l'Atto è entrato in vigore il 26 luglio 1999). Nel sistema estone della salute e della sicurezza professionali, il ministro degli Affari sociali rappresenta l'autorità esecutiva che dirige l'intero settore, mentre due delle sue unità strutturali (il Dipartimento per lo Sviluppo della vita lavorativa e il Dipartimento della Sanità) sono direttamente implicate nelle decisioni politiche riguardanti la salute e la sicurezza professionali. Il punto focale nazionale in Estonia dell'EU-OSHA opera in seno al ministero degli Affari sociali (il Dipartimento per lo Sviluppo della vita lavorativa). Attualmente la rete del punto focale comprende 16 istituzioni governative e non governative.
Il punto focale nazionale funge da rappresentante dell'Agenzia in Estonia e agisce quale organismo intermedio tra l'Agenzia e lo Stato membro nelle attività di competenza nonché quale organismo di coordinamento per le attività a livello di Stato membro. Lo scopo del sito web del punto focale è di fornire informazioni esaurienti tanto a livello nazionale quanto a quello dell'UE circa la salute e la sicurezza professionali, in particolare relativamente alle buone prassi e alle campagne europee.
L’Ispettorato del lavoro è responsabile della sorveglianza statale in questioni di diritto del lavoro e di conformità ai requisiti in materia di salute e sicurezza sul lavoro. Gestisce inoltre uno sportello informazioni telefonico al quale i datori di lavoro e i lavoratori possono rivolgersi per delucidazioni sul tema del diritto del lavoro e dell’ambiente di lavoro.